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黏液物質染色有多種方法,如AB-PAS染色、黏液HID-AB染色、標準阿利新藍染色等,以上方法大多是利用阿利新藍(Alcian)屬于陽離子染料可與酸性基團結合,也即阿爾辛藍與組織內含有的陰離子基團如羧基和硫酸根形成不溶性復合物這一原理。
Leagene黏蛋白染色液(溫和甲基化法)屬于化學修飾和阻斷法的一種,其原理是利用含酒精的堿性溶液裂解耐酶唾液酸中的O-乙酰基,O-乙酰基的去除及唾液酸側鏈羥基的形成恢復了唾液酸對PAS的反應性;Alcian染色液pH值為2.5時組織內的羧基電離,帶有一個負電荷,與阿利新藍中的陽離子形成鹽鍵,使帶有羧基的組織(如蛋白多糖/透明質酸以及上皮酸性黏蛋白)染色,主要用于鑒別黏蛋白中的酸性基團。該試劑僅用于科研領域,不適用于臨床診斷或其他用途。